“准确、快速、便利、安全”
这是我们对工作站的要求按优先级排序。
但“纸上谈兵”终觉浅,绝知此“站”要躬行。
对此类产品客户往往有一个最大的担心——
用设备去做是否会出现假阳性(不同样本的交叉污染)
为让客户更放心,于是我们着手深入自动化工作站测试工作,此次友康测试了真正的病毒样本(正规渠道购自国家机构,无传染能力),友康全自动核酸提取仪FE4800首次实地“试飞”圆满成功!
一:背景知识
为什么可能会出现样本的交叉污染?
——出现交叉污染的原因在于采样管之间的距离,以及深孔板不同孔板之间的距离较短。以及设备转移液体过程中,不可避免会产生气溶胶。一个样本的气溶胶,如果落入另外一个样本中,就会产生样本的交叉污染。我们的设备可以在一个时间点同时处理8个样本,客户有疑惑很正常。
这种交叉污染为什么必须要避免?
——不是所有的交叉污染都会产生严重后果,但分子领域的交叉污染确实会产生极为严重的后果,原因在于在后端的检测原理是多次复制初始的样本。以目前临床检测阳性阴性分界线的CT值为35来计算,即初始样本需复制2的35次方倍。即640亿倍。初始一个核酸,经过扩增可扩增至640亿个核酸。是惊人的。所以,样本只要被别的样本污染,结果错误是不可避免。
二:实验目的
对友康全自动样本处理与核酸提取工作站的使用性能做出系统的评价,验证该设备正常提取过程中,无气溶胶污染的问题出现。
三:实验设计
1、 为考验本提取设备在较为极端的条件下是否会存在交叉污染的情况,采用较多的强阳性样本与阴性样本进行交错摆放,并进行3个批次的重复实验。
2、 一批提取48个样本,设置其中27个为含病毒样本,同时设置21个无病毒样本。
3、 阳性样本的病毒浓度为109 copies/mL。(参考临床实际阳性样本浓度上限)
4、 带有病毒的样本与空样本之间交叉间隔摆放,同时设置阳性样本围绕阴性样本(下表中的阴-6样本)以及阴性样本围绕阳性样本(下表中的2-1样本)的情况,具体摆放顺序如下:
阴性样本与阳性样本具体布局。
阴 | 阴 | 阴 | 阳 | 阴 | 阳 | 阴 | 阳 |
阴 | 阳 | 阴 | 阳 | 阴 | 阳 | 阴 | 阳 |
阴 | 阴 | 阴 | 阳 | 阳 | 阴 | 阳 | 阴 |
阳 | 阳 | 阳 | 阳 | 阳 | 阳 | 阳 | 阴 |
阳 | 阴 | 阳 | 阳 | 阳 | 阴 | 阳 | 阳 |
阳 | 阳 | 阳 | 阳 | 阴 | 阴 | 阴 | 阴 |
四:操作步骤
1、 病毒液的配制。
2、 病毒样本的加入。将病毒液以1:9的体积比例加入至采样管中。共设置27个含有病毒的采样管,分别标记序号,并做好记录。每个采样管中折断一个拭子进去。充分振荡 混匀。
3、 仪器所需试剂的配制。共需要三种试剂,分别为异丙醇与磁珠的混合液15.36mL(包含14.4mL的异丙醇与960μL的磁珠)、纯化液38.4mL和洗脱液4.8mL。
4、 将27管按照从左向右,从上向下的顺序依次插入预先设定好的孔位,将无病毒样本的阴性对照管插入剩余的21个孔中,启动程序,进行提取。
5、 进行反转录荧光定量PCR检测,检测21个阴性样本,同时设置一个含有病毒核酸的孔作为阳性对照。
6、 实验进行3批重复。
五:实验结果
1、第一批次各组扩增曲线如下:
注:只有阳性对照组出现扩增曲线,阴性对照和其余各组均没有扩增出来。
数据统计:
组别 | Ct值 | 组别 | Ct值 | 组别 | Ct值 |
阴-1 | NoCt | 阴-8 | NoCt | 阴-15 | NoCt |
阴-2 | NoCt | 阴-9 | NoCt | 阴-16 | NoCt |
阴-3 | NoCt | 阴-10 | NoCt | 阴-17 | NoCt |
阴-4 | NoCt | 阴-11 | NoCt | 阴-18 | NoCt |
阴-5 | NoCt | 阴-12 | NoCt | 阴-19 | NoCt |
阴-6 | NoCt | 阴-13 | NoCt | 阴-20 | NoCt |
阴-7 | NoCt | 阴-14 | NoCt | 阴-21 | NoCt |
阳性对照 | 27.95 | 阴性对照 | NoCt |
2、第二批次各组扩增曲线如下:
注:只有阳性对照组出现扩增曲线,阴性对照和其余各组均没有扩增出来。
数据统计:
组别 | Ct值 | 组别 | Ct值 | 组别 | Ct值 |
阴-1 | NoCt | 阴-8 | NoCt | 阴-15 | NoCt |
阴-2 | NoCt | 阴-9 | NoCt | 阴-16 | NoCt |
阴-3 | NoCt | 阴-10 | NoCt | 阴-17 | NoCt |
阴-4 | NoCt | 阴-11 | NoCt | 阴-18 | NoCt |
阴-5 | NoCt | 阴-12 | NoCt | 阴-19 | NoCt |
阴-6 | NoCt | 阴-13 | NoCt | 阴-20 | NoCt |
阴-7 | NoCt | 阴-14 | NoCt | 阴-21 | NoCt |
阳性对照 | 28.55 | 阴性对照 | NoCt |
3、第三批次各组扩增曲线如下:
注:只有阳性对照组出现扩增曲线,阴性对照和其余各组均没有扩增出来。
数据统计:
组别 | Ct值 | 组别 | Ct值 | 组别 | Ct值 |
阴-1 | NoCt | 阴-8 | NoCt | 阴-15 | NoCt |
阴-2 | NoCt | 阴-9 | NoCt | 阴-16 | NoCt |
阴-3 | NoCt | 阴-10 | NoCt | 阴-17 | NoCt |
阴-4 | NoCt | 阴-11 | NoCt | 阴-18 | NoCt |
阴-5 | NoCt | 阴-12 | NoCt | 阴-19 | NoCt |
阴-6 | NoCt | 阴-13 | NoCt | 阴-20 | NoCt |
阴-7 | NoCt | 阴-14 | NoCt | 阴-21 | NoCt |
阳性对照 | 29.72 | 阴性对照 | NoCt |
六:实验结论
同一批提取检测中,阴性样本与阳性样本交叉摆放,结果阴性样本孔均检出,阳性对照孔正常检出。说明本设备可以有效避免样本间交叉污染的问题出现。
写在后面:
目前市场上所有的核酸自动化工作站,我们选择成为为数不多为用户提供设备使用样本的实测数据的供应商。之后我们会继续进行多批次多样本的测试,以确保该设备确实能够满足客户的需求。让我们一起拭目以待!